对于防治包括学术腐败、招生腐败、基建腐败在内的高校腐败，杨玉圣教授认为，关键还在于“高校去行政化”，这乃完善现代大学制度的必由之路。
储朝晖研究员对此表示赞同，他告诉法治周末记者：“要想真正解决高校的腐败问题，就要加快高校去行政化的改革，不断推进‘自主办学、学术自治、教授治校、学生自治’的现代大学制度建设。”
储朝晖表示，建立现代大学制度，有三个层面的制度非常重要：一是校长的遴选机制；二是校内的学术事务(人怎么进、钱怎么用、课题怎么立等)应该由专门的“平头”教授组成的教授会或学术委员会来把关进行；三是要有真实的学生自治组织，在学校重大的决定事务中，应该要有学生的参与。
他认为，推进高校去行政化改革，既要包括学校外部的去行政化，彻底落实学校的办学自主权，政府部门不干涉学校办学；更要推进学校内部的去行政化，拥有行政权力的领导不得越权干预教育、学术事务等方面；同时建立规范的权力运行分配机制，不能将权力过分集中在某些人手中，做任何决策都应该充分发挥公平民主、公开透明。
“高校的反腐倡廉不光要靠自身建立科学民主的制度，同时需要有力的监督惩治措施加以保证。”储朝晖表示，高校反腐败工作需要多管齐下、综合治理，除了推进公众参与机制外，还应加强高校纪检监察队伍建设，在适当的时机可以推行纪检监察垂直管理，避免内设机构可能存在的监督疲软等问题。
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